V centru Holešovic se skrývá neobvyklý architektonický klenot – kaple svatého Jana, která tvoří součást Modrého domu na adrese Špejchar 3. Přistavěna ze severovýchodní strany budovy, obklopena dvorem se živým plotem, je to jediný vlastní sakrální prostor české Obce křesťanů. Pro tuto komunitu má mimořádný význam, neboť je zároveň největší vlastní místností, kterou má v České republice k dispozici.

Kaple vznikala během roku 1995 podle návrhu architekta Petra Kříže. Její vznik znamenal originální řešení: vznikla rozšířením a zahloubením starší garáže a skladu v přístavbě na severní straně domu. Slavnostního vysvěcení se dočkala 16. září 1995. Interiérový koncept vychází z antroposofické architektury, stavebního stylu, který Obec křesťanů uplatňuje ve svých prostorech po celém světě.

Prostor kaple vytváří podélná chrámová loď o rozměrech 8,4 krát 16,8 metrů, orientovaná tradičním východozápadním směrem. Členění je přitom logické a funkční: vyvýšené kněžiště na východní straně pro celebranty, hlavní prostor uprostřed pro shromáždění věřících a vyvýšené jeviště na straně západní, určené pro příležitostné neliturgické využití. Dosažení výšky 4,2 metru bylo možné jen díky odvážnému zahloubení střední části stavby. Lehce zalamované stěny kaple jsou lazurovány světlefialovými tóny, které se směrem k oltáři postupně ztmavují. Podobně jednoduchý je i strop z nehoblovaných prken v tónech světlé lazury. Denní osvětlení přichází dvěma dřevěnými okny v severní stěně a prosklenou částí vchodu ze dvora. Elektrické osvětlení zajišťují tři páry nástěnných svítidel, vybavených také olejovými kahany.

Uměleckou výzdobu tvoří prvky velmi zdrženlivě volené. Svítidla, oltář, kazatelna a liturgický stolek vznikly na zakázku podle návrhu faráře Franka Peschela. Barevná malba na oknech je dílem výtvarnice Michaely Pokové. Oltářní obraz, zachycující tvář žehnajícího Krista s křížem Golgoty v dolní části, pochází z tvorby Ninétty Sombart. Zajímavou vlastností kaple je její výtečná akustika, kterou umožňují harmonické základní rozměry a vhodné řešení stěn a stropu – navíc je na zvukotechniku zcela nehledí.

Kaple slouží primárně bohoslužbám pražského sboru Obce křesťanů. Protože jde ale o jedinou vlastní větší místnost této komunity v Česku, bývá často pronajímána i pro veřejné kulturní akce – divadelní představení, koncerty či semináře. Běžně pojme osmdesát návštěvníků na židlích; při větších akcích lze kapacitu navýšit přidáním dalšího nábytku. Vytápění zajišťuje podlahový systém napojen na centrální vytápění domu, odvětrávání řeší ručně ovládaný ventilátor.