Kostel svatého Ondřeje se nachází východně od vesnice Chlístovice, kde stojí o samotě na vyvýšeném místě nad malou říčkou Vrchlicí. Areál s hřbitovní zdí je chráněn jako kulturní památka. Stavba patří k architektonickým zajímavostem Kutnohorska, kde se prolínají gotické základy s mladšími barokními úpravami.

Kostela byla založena v období vrcholné nebo pozdní gotiky, pravděpodobně na místě starší stavby. Chlístovice přitom již ve 14. století patřily pražské kapitule při chrámu sv. Víta. Historicky je kostel doložen k roku 1352 pod jménem Hrádek. Významný obrat v osudech stavby přinesl konec husitských válek, kdy kapitulní majetek získal Jan Roháč z Dubé. Tento vojevůdce si nedaleko postavil svůj hrad Sion, s nímž se kostel navždy propojil. Věž byla ke kostelu přistavěna později – dendrochronologický průzkum naznačuje nejdříve konec 15. století. Dřevěné zvonové patro vzniklo během stavebních úprav v 80. letech 16. století. Barokní přestavba pak proběhla počátkem 18. století.

Stavba má výraznou gotickou kompozici: obdélnou loď s polygonálním presbyterem, které kryjí ploché stropy. K lodi přiléhá věž s vysazeným dřevěným zvonovým patrem. Wesele do lodi otevírá jednoduché hrotité portály. Pod věží se rozprostírá podvěží s valenou klenbou. Barokní ráz kostela zdůrazňuje štít v západním průčelí. Ve věži se zachoval cenný zvon z roku 1509, který sejmul kutnohorský zvonař Ondřej Ptáček. Nápis na něm připomíná, že byl odlit k uctění památky Jana Roháče z Dubé.

S kostelem se pojí několik pověstí a faktů. Podle místní tradice nechal Ondřej z Dubé, prastrýc Jana Roháče a nejvyšší zemský sudí, rozsypat hlínu z jeruzalémské hory Sion právě v místě kostela. V průběhu 20. století byly prováděny různé průzkumy – v 50. letech například objevili krátkou chodbu směrem k farské stráni. Novější georadarový výzkum však mnohé z těchto nálezů nepotvrdil. V roce 2025 jsou ve věži dva zavěšené zvony: starší svatý Václav a novější svatý Josef, který rodina věnovala v roce 2023 na přání chlístovického rodáka Josefa Strnada, odbojáře padlého za druhé světové války.

V roce 2017 byl založen spolek Sionský kostelík, který se ujal péče o obnovu stavby. Díky transparentnímu účtu se podařilo získat podporu širší veřejnosti. Na podzim 2021 pořádal spolek Setkání na Sioně, při kterém byl kostel veřejnosti otevřen. Z dobrovolného vstupného se vybralo 45 tisíc korun. Dnes zůstává kostela svědkem staletí české historie, od doby gotického vzniku přes husitské války až po dnešní časy.